O Mosteiro de Santa Maria das Júnias foi, provavelmente, construído sobre um eremitério do século IX.
A epígrafe que ainda se encontra no exterior da igreja, faculta-nos a datação de 1185 e sabemos que este mosteiro foi, na sua origem, Beneditino, tendo-se tornado Cisterciense em 1248.
Com um curso de água e com campos aráveis e convidativos para a pastorícia, os monges encontraram neste vale o local ideal para se tornarem autossuficientes.